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1、【化学合成原料药生产工艺】
化学合成药物是原料药生产的主要方式，通常是起始物料与其他化合物通过若干步骤的化学反应得到目标产物的特定的化学结构，例如缩合、取代、酰化、氧化还原等；然后再经过一步或几步的精制，例如脱色、重结晶等，得到最终的原料药产品。
其中中间体和粗品的生产一般是在无洁净级别的一般区进行，而最终成品的精烘包工序在洁净区进行。化学合成原料药车间（以下简称合成车间）设计的优劣，对原料药厂家的生产至关重要。而车间布置是工艺设计中的重要部分，只有合理的工艺布置才能实现工艺流程及设备的先进，才能为车间生产、操作、设备安装检修以及为安全卫生、环保创造良好的环境。
2、【发酵类原料药生产工艺】
发酵也是原料药生产工艺的重要方式之一，尤其是抗生素类原料药，例如青霉素类、头孢类等，通常是通过发酵和化学合成结合的半合成方式得到的。首先通过生物发酵得到目标化合物的主要结构，例如青霉素特定的3-内酰胺结构，然后再进行结构修饰，得到最终的目标化合物；经过精制重结晶，得到最终的原料药产品。发酵过程一般需要经过培养基的制备、消罐处理、接种、发酵、破壁、过滤、沉淀、离心、干燥等过程。
3、【无菌原料药生产工艺】
与无菌制剂相同，无菌原料药也分为最终灭菌的无菌原料药和非最终灭菌的无菌原料药，但由于原料药大多对高温高热、高湿高压、辐射等敏感，采用最终灭菌的无菌原料药很少。目前非最终灭菌的无菌原料药通常是将产品后一步的精制或成盐与除菌工艺相结合，采用预过滤加两级0.22 um 的除菌过滤实现最终产品无菌的。经过除菌过滤后的料液通常釆用结晶、冻干或喷雾干燥的方式得到最终的无菌原料药产品。